Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm21972J3QN38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21972J3QN38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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