Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20828J3KMI7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20828J3KMI7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282 ms