Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pot1bH7BX60 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pot1bH7BX60 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms