Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arfip1G5E8V9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms