Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf148G3X9R7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms