Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hmgxb3G3X9M3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms