Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a3G3X939 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a3G3X939 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms