Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Speer4cG3UXD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms