Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r167G3UW71 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r167G3UW71 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms