Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NpcdF8VQB8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NpcdF8VQB8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms