Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Colca2F8VPY8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Colca2F8VPY8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms