Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp9yF8VPU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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