Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arid4aF8VPQ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arid4aF8VPQ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arid4aF8VPQ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Arid4aF8VPQ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arid4aF8VPQ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms