Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd50F7BE84 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd50F7BE84 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms