Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8005F6YKY3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8005F6YKY3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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