Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r40F6W043 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms