Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp988F6VKC7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms