Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms