Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17555F6U8B9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms