Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngap1F6SEU4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngap1F6SEU4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms