Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm340F6RGI3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm340F6RGI3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms