Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc74aE9Q9U8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms