Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc146E9Q9F7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms