Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r48E9Q5D8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn2r48E9Q5D8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms