Protein–RNA interactions for Protein: E9Q468

Npffr1, Neuropeptide FF receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npffr1E9Q468 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Npffr1E9Q468 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Npffr1E9Q468 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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