Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApobE9Q414 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms