Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms