Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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