Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Ccdc171E9Q1U1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Ccdc171E9Q1U1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc171E9Q1U1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Ccdc171E9Q1U1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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Ccdc171E9Q1U1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Ccdc171E9Q1U1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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