Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Pdzd2E9Q1M1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Pdzd2E9Q1M1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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