Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Zfp558E9Q1J0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Zfp558E9Q1J0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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