Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt78E9Q0F0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms