Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx60E9PZQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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