Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gcom1E9PZ54 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms