Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abca16E9PWJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abca16E9PWJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Abca16E9PWJ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms