Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3002E9PW72 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3002E9PW72 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms