Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms