Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc62E9PVD1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms