Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gcn1E9PVA8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms