Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms