Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms