Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Soga1E1U8D0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms