Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms