Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms