Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
5430403G16RikD3Z5L4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms