Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5930D3Z257 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5930D3Z257 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms