Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms