Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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