Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smok3bC0HKC9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smok3bC0HKC9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms