Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms